Detección de virus en camote (Ipomoea batatas L.) mediante qPCR
DOI:
https://doi.org/10.15517/am.v31i1.37668Palabras clave:
virosis, PCR múltiple, batata, Costa Rica, hortaliza de raízResumen
Introducción. El camote (Ipomoea batatas) es un cultivo muy susceptible a las enfermedades virales, las cuales se han asociado con una disminución del rendimiento del cultivo mayor al 50 %. En las plantaciones de camote costarricenses se ha reportado la presencia del virus del moteado plumoso (SPFMV), el virus del enanismo clorótico (SPCSV) y el virus del enrollamiento de la hoja (SPLCV); para el desarrollo de programas adecuados de control de estos virus, es necesaria la detección e identificación temprana mediante el uso de técnicas sensibles y eficientes. Objetivo. El objetivo de esta investigación fue estimar la incidencia del SPFMV, el SPCSV y el SPLCV en plantaciones de camote mediante qPCR. Materiales y métodos. En el 2018 se recolectaron muestras de tejido foliar de ochenta plantas con síntomas de infección viral en veinticinco plantaciones de camote distribuidas en cuatro provincias de Costa Rica. La detección de los tres virus se llevó a cabo mediante qPCR con el empleo de imprimadores y sondas de hidrólisis específicos. Resultados. En el 92 % de las plantaciones analizadas se encontró la presencia de virosis. La enfermedad viral del camote (SPVD), definida como la infección combinada del SPFMV y el SPCSV, fue la que se detectó con más frecuencia. Las plantaciones ubicadas en las localidades de Sabanilla, El Cacao y La Guácima de Alajuela fueron las únicas en presentar los tres virus estudiados. El virus SPLCV solamente fue detectado en las provincias de Limón y Alajuela. Conclusión. Es posible realizar una detección temprana de tres de los virus más frecuentes en camote con el empleo de qPCR, lo que contribuiría con los programas de producción de semilla certificada.
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Alam, I., S.A. Sharmin, M.K. Naher, M.J. Alam, M. Anisuzzaman, and M.F. Alam. 2013. Elimination and detection of viruses in meristem-derived plantlets of sweet potato as a low-cost option toward commercialization. 3 Biotech 3:153-164. doi:10.1007/s13205-012-0080-6
Altschul, S.F., W. Gish, W. Miller, E.W. Myers, and D.J. Lipman. 1990. Basic local alignment search tool. J. Mol. Biol. 215:403-410. doi:10.1016/S0022-2836(05)80360-2
Arkorful, E., and F. Addae-Frimpomaah. 2015. Detection of sweet potato (Ipomoea batatas L.) Leaf Curl Virus (SPLCV) in Ghana using visual symptomatology and PCR technique. Int. J. Plant Breed. Genet. 9:106-115. doi:10.3923/ijpbg.2015.106.115
Barkessa, M.K.E. 2018. A review on sweet potato (Ipomoea batatas) viruses and associated diseases. Int. J. Res. Agric. For. 5(9):1-10.
Castillo-Matamoros, R., A. Brenes-Angulo, P. Esker, y L. Gómez-Alpízar. 2014. Evaluación agronómica de trece genotipos de camote (Ipomoea batatas L). Agron. Costarricense 38(2):67-81.
CATIE (Centro Agronómico Tropical de Investigación y Enseñanza). 2014. Relieve2008crtm05. Atlas CR 2014. [CD]. ITCR, Cartago, CRI.
Clark, C.A., J.A. Davis, S.B. Mukasa, J. Abad, A.K. Tugume, W.J. Cuellar, S. Fuentes, J.F. Kreuze, F.D. Tairo, R.W. Gibson, and J.P.T. Valkonen. 2012. Sweet potato viruses: 15 Years of progress on understanding and managing complex diseases. Plant Dis. 96:168-184. doi:10.1094/PDIS-07-11-0550
Clark, C.A., and M.W. Hoy. 2006. Effects of common viruses on yield and quality of Beauregard sweet potato in Louisiana. Plant Dis. 90:83-88. doi:10.1094/PD-90-0083
Clark, C.A., and R.A. Valverde. 2009. Viruses and sweet potato cultivar decline in Louisiana USA. In: Y. Nakazawa, and K. Ishiguro, editors, Proceedings of International workshop sweet potato cultivar decline study. Kyushu National Agricultural Experiment Station (KNAES), Miyakonjo, JPN. p 62-69.
Fenby, N.S., S. Seal, R.W. Gibson, and G.D. Foster. 1998. RNA extraction from virus-diseased sweet potato for reverse transcriptase polymerase chain reaction analysis. Mol. Biotechnol. 10:187-190. doi:10.1007/BF02760865
Figueroa-Escudero, S.E. 2015. Evaluación de dos sistemas de producción de semilla prebásica de camote (Ipomoea batatas L.). Tesis Lic., Universidad Agraria La Molina, Lima, PER.
Gibbs, A., and A. Mackenzie. 1997. A primer pair for amplifying part of the genome of all potyvirids by RT-PCR. J. Virol. Methods 63:9-16. doi:10.1016/S0166-0934(96)02103-9
Gibson, R.W., V. Aritua, E. Byamukama, I. Mpembe, and J. Kayongo. 2004. Control strategies for sweet potato virus disease in Africa. Virus Res. 100:115-122. doi:10.1016/j.virusres.2003.12.023
Gibson, R.W., I. Mpembe, T. Alicai, E.E. Carey, R.O.M. Mwanga, S.E. Seal, and H.J. Vetten. 1998. Symptoms, aetiology and serological analysis of sweet potato virus disease in Uganda. Plant Pathol. 47:95-102. doi: 10.1046/j.1365-3059.1998.00196.x
Geotecnologías. 2014. Provincias2014crtm05. Atlas CR 2014. [CD]. ITCR, Cartago, CRI.
Gutiérrez, D.L., S. Fuentes, and L.F. Salazar. 2003. Sweet potato virus disease (SPVD): Distribution, incidence, and effect on sweet potato yield in Peru. Plant Dis. 87:297-302. doi:10.1094/PDIS.2003.87.3.297
Hall, T.A. 1999. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symp. Ser. 41:95-98.
INIA (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria). 2010. XX Curso internacional teórico práctico de detección e identificación de virus, viroides y fitoplasmas. INIA, Madrid, ESP.
Kays, S.J. 2005. Sweet potato production worldwide: Assessment, trends and the future. Acta Hort. 670:19-25. doi:10.17660/ActaHortic.2005.670.2
Kokkinos, C.D., and C.A. Clark. 2006. Real-time PCR assays for detection and quantification of sweetpotato viruses. Plant Dis. 90:783-788. doi:10.1094/PD-90-0783
Li, F., R. Zuo, J. Abad, D. Xu, G. Bao, and R. Li. 2012. Simultaneous detection and differentiation of four closely related sweet potato potyviruses by a multiplex one-step RT-PCR. J. Virol. Methods 186:161-166. doi:10.1016/j.jviromet.2012.07.021.
Lotrakul, P., R.A. Valverde, C.A. Clark, and C.M. Fauquet. 2003. Properties of a Begomovirus isolated from sweet potato [Ipomoea batatas (L.) Lam.] infected with sweet potato leaf curl virus. Rev. Mex. Fitopatol. 21(2):128-136.
Maina, S., M.J Barbetti, D.P. Martin, O.R. Edwards, and R.A. Jones. 2018. New isolates of sweet potato feathery mottle virus and sweet potato virus C: biological and molecular properties, and recombination analysis based on complete genomes. Plant Dis. 102:1899-1914. doi:10.1094/PDIS-12-17-1972-RE
Opiyo, S.A., E.M. Ateka, P.O. Owuor, L.O.A. Manguro, and D.W. Miano. 2010. Development of a multiplex PCR technique for simultaneous detection of Sweet potato feathery mottle virus and Sweet potato chlorotic stunt virus. J. Plant Pathol. 92:363-366. doi:10.4454/jpp.v92i2.178
QGIS Development Team. 2019. QGIS User guide. Release 3.4. QGIS project. QGIS. https://docs.qgis.org/3.4/pdf/en/QGIS-3.4-UserGuide-en.pdf (accessed Apr.15, 2019).
Pardina, P.R., A. Luque, C. Nome, E.L. Colomba, S.F. Delgado, and L. Di Feo. 2012. First report of Sweet potato leaf curl virus infecting sweet potato in Argentina. Australas. Plant Dis. Notes 7:157-160. doi:10.1007/s13314-012-0073-7
Proyecto Atlas Digital CR. 2008-2014. Línea continental. Atlas CR 2014. [CD]. ITCR, Cartago, CRI.
Torres, S., W. Montero, y I. Varela. 2013. Desarrollo de una metodología para el diagnóstico viral y la producción de plantas de camote libres de virus Código: 5402-2151-8701. Instituto Tecnológico de Costa Rica, CRI. https://repositoriotec.tec.ac.cr/bitstream/handle/2238/3237/desarrollo_metodologia_diagnostico_viral_produccion.pdf?sequence=1&isAllowed= (consultado 15 feb. 2019).
Untiveros, M., S. Fuentes, and J. Kreuze. 2008. Molecular variability of sweet potato feathery mottle virus and other potyviruses infecting sweet potato in Peru. Arch. Virol. 153:473-483. doi:10.1007/s00705-007-0019-0
Valverde, R., y M.A. Moreira. 2004. Identificación de virus en el cultivo de camote (Ipomoea batatas L.) en Costa Rica. Agron. Mesoam. 15:1-7. doi:10.15517/AM.V15I1.11921
Valverde, R.A., C.A. Clark, and J.P.T Valkonen. 2007. Viruses and virus disease complexes of sweet potato. Plant Viruses 1:116-126.
Webster, C.G., S.J. Wylie, and M.G.K. Jones. 2004. Diagnosis of plant viral pathogens. Curr. Sci. 86:1604-1607.
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