Expresión genética en Longissimus dorsi e hígado en dos etapas del crecimiento en cerdos

Clemente Lemus-Flores; Job Oswaldo Bugarín-Prado; Gilberto Lemus-Avalos; Henry Loeza-Concha

doi:10.15517/am.2024.57540

Autores/as

Clemente Lemus-Flores Universidad Autónoma de Nayarit, Nayarit, México https://orcid.org/0000-0002-5120-6805
Job Oswaldo Bugarín-Prado Universidad Autónoma de Nayarit, Nayarit, México https://orcid.org/0000-0001-6280-8281
Gilberto Lemus-Avalos Universidad Autónoma de Nayarit, Nayarit, México https://orcid.org/0000-0003-2451-1940
Henry Loeza-Concha Colegio de Postgraduados, Campeche, México https://orcid.org/0000-0001-7686-5113

DOI:

https://doi.org/10.15517/am.2024.57540

Palabras clave:

cromosoma, transcriptoma, método , DESeq2

Resumen

Introducción. La expresión genética varía en relación con la etapa fisiológica del cerdo y es diferente en músculo e hígado. Objetivo. Identificar los genes con expresión genética diferencial en los procesos biológicos del cerdo en los tejidos Longisimus dorsi e hígado, por medio del análisis de transcriptoma, durante la etapa de crecimiento (55 ± 1,05 kg) y la engorda final (101 ± 7,8 kg). Materiales y métodos. En la Unidad Académica de Agricultura de la Universidad Autónoma de Nayarit, México, durante el verano del 2019. Se consideraron 12 muestras totales, tres de músculo Longissimus dorsi y tres de hígado por etapa para la extracción de RNA y la secuenciación. Con el método DESeq2 se obtuvo diferencialmente la expresión génica de los Log2FC para Grupo Crecimiento vs Engorda Final del Longissimus dorsi e Higado y se identificó la función biológica de los genes con expresión genética diferencial. Resultados. En hígado se identificaron la mayor cantidad de genes con DEG y en el cromosoma 6 para Longissimus dorsi e higado. En Longissimus dorsi del Grupo crecimiento se expresaron los genes FUT1, SESN2 y FGF21 asociados al crecimiento, tambien se identificaron genes sin expresión como NR4A3, PDK4, PER1 y PTPRO los cuales estan involucrados en procesos del sistema inmune y ritmo circadiano. En hígado del Grupo crecimiento se expresaron los genes IHH y MYL7 y sin expresión MFSD2A, LIPG, THBS1, TGFB2, LTF y APOA4 como los más relacionados en procesos biológicos. Conclusiones. En Longissimus dorsi del grupo crecimiento los genes se relacionaron con el crecimiento y en engorda final con inmunidad, crecimiento y calidad de la carne. En hígado del grupo crecimiento los genes fueron relacionados con el crecimiento y en el grupo engorda final con inmunidad, crecimiento¸ metabolismo de nutrientes y lípidos, lipoproteínas y detoxificación.

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