Identificación molecular de aislamientos de Fusarium asociados a maracuyá en el Valle del Cauca, Colombia
DOI:
https://doi.org/10.15517/ma.v29i1.27114Palabras clave:
fusariosis, Passiflora edulis, enfermedades fungosas, variación genética.Resumen
La producción de maracuyá en Colombia ha mostrado grandes avances; sin embargo, las enfermedades continúan siendo un factor limitante en la producción del mismo. Entre los agentes patógenos que dificultan el establecimiento y desarrollo del cultivo, se encuentran algunas especies del género Fusarium, consideradas de importancia económica por las pérdidas que generan. El objetivo de este trabajo fue identificar molecularmente las poblaciones de Fusarium presentes en maracuyá (Passiflora edulis). Entre enero y diciembre de 2015 se realizó el aislamiento de 35 muestras de diferentes órganos afectados de la planta y provenientes de localidades ubicadas en cinco municipios del Valle del Cauca, Colombia. Se seleccionaron y purificaron ocho aislamientos pertenecientes al género de interés para realizar la extracción de ADN y amplificación de la región TEF 1 alpha. Los productos de PCR fueron secuenciados y comparados con las bases de datos del NCBI y del Fusarium ID. Los aislamientos pertenecían a: Fusarium incarnatum, Fusarium proliferatum y Fusarium solani, la primera especie fue la de mayor ocurrencia en las muestras evaluadas. En el análisis de las relaciones filogenéticas realizado mediante el programa MEGA 6, se usó el coeficiente de similitud del vecino más cercano, lo que permitió observar variabilidad entre los aislamientos evaluados.
Descargas
Citas
Agrios, G. 2005. Plant pathology. 5th ed. Elsevier Academic Press, San Diego, CA, USA.
Aoki, T., K. O’Donnell, and D.M. Geiser. 2014. Systematics of key phytopathogenic Fusarium species: current status and future challenges. J. Gen. Plant Pathol. 80:189-201. doi:10.1007/s10327-014-0509-3
Balajee, S.A., A.M. Borman, M.E. Brandt, J. Cano, M. Cuenca-Estrella, E. Dannaoui, J. Guarro, G. Haase, C.C. Kibbler, W. Meyer, K. O’Donnell, C.A. Petti, J.L. Rodriguez-Tudela, D. Sutton, A. Velegraki, and B.L Wickes. 2009. Sequence-based identification of Aspergillus, Fusarium, and Mucorales species in the clinical mycology laboratory: where are we and where should we go from here? J. Clin. Microbiol. 47:877-884. doi:10.1128/JCM.01685-08
Campo-Arana, O., y L. Vergara-Canedo. 2014. Evaluación de la resistencia de la población de maracuyá amarillo (Passiflora edulis f. flavicarpa. Degener), de San Isidro, Córdoba, a la marchitez vascular (Fusarium spp.). Fitopatol. Colomb. 38:39-42.
Cañedo, V., y T. Ames. 2004. Manual de laboratorio para el manejo de hongos entomopatógenos. Centro Internacional de la Papa (CIP), PER. http://www.cipotato.org/library/pdfdocs/AN65216.pdf (consultado 15 may. 2016).
Carrillo, L. 2003. Los hongos de los alimentos y los forrajes. Universidad Nacional de Salta, ARG. http://www.microbiota.com.ar/sites/default/files/0cubierta.pdf (consultado 23 nov. 2016).
Castellá, G., and F.J. Cabañes. 2014. Phylogenetic diversity of Fusarium incarnatum-equiseti species complex isolated from Spanish wheat. Antonie Van Leeuwenhoek 106:309-317. doi:10.1007/s10482-014-0200-x
Cubillos, J.G., A. Páez, y L. Mejía. 2011. Evaluación de la capacidad biocontroladora de Trichoderma harzianum Rifai contra Fusarium solani (Mart.) Sacc. asociado al complejo “Secadera” en Maracuyá, bajo condiciones de invernadero. Rev. Fac. Nal. Agron. Medellín. 64:5821-5830.
Dean, R., J.A. Van-Kan, Z.A. Pretorius, K.E. Hammond-Kosack, A. Di-Pietro, P.D. Spanu, J.J Rudd, M. Dickman, R. kahmann, J. Ellis, and G.D. Foster. 2012. The Top 10 fungal pathogens in molecular plant pathology. Mol. Plant Pathol. 13:414-430. doi:10.1111/j.1364-3703.2011.00783.x
Edel, V., N. Steinberg, G. Gautheron, C. Recorbet, and C. Alabouvette. 2001. Genetic diversity of Fusarium oxysporum populations isolated from different soils in France. FEMS Microbiol. Ecol. 36:61-71. doi:10.1146/annurev.phyto.40.030402.110010.
Fischer, I.H., M. de-Arruda, A. de-Almeida, M.J. García, E. Jeronimo, R. Nakazato, e R. de-Almeida. 2007. Doenças e características físicas e químicas pós-colheita em maracujá amarelo de cultivo convencional e orgânico no centro oeste paulista. Rev. Bras. Frutic. 29:254-259. doi:10.1590/S0100-29452007000200013
Fischer, I., and J. Rezende. 2008. Diseases of passion flower (Passiflora spp.). Pest Technol. 2:1-19.
Geiser, D.M., T. Aoki, C.W. Bacon, S.E. Baker, M.K. Bhattacharyya, M.E. Brandt, D.W. Brown, L.W. Burgess, S. Chulze, J.J. Coleman, J.C. Correll, S.F. Covert, P.W. Crous, C.A. Cuamo, G.S. De-Hoog, A. Di-Pietro, W.H. Elmer, L. Epstein, R.J. Frandsen, S. Freeman, T. Gagkaeva, A.E. Glenn, T.T. Gordon, N.F. Gregory, K.E. Hammond-Kosack, L.E. Hanson, M.M. Jímenez-Gasco, S. Kang, H.C. Kistier, G.A. Kuldau, J.F. Leslie, A. Logrieco, G. Lu, E. Lysøe, L.J. Ma, S.P. McCormick, Q. Migheli, A. Moretti, F. Munaut, K. O`Donnell, L. Pfenning, R.C. Ploetz, R.H. Proctor, S.A. Rehner, V.A. Robert, A.P. Rooney, B. Bin-Salleh, M.M. Scandiani, J. Scauflaire, D.P. Short, E. Steenkamp, H. Suga, B.A. Summerell, D.A. Sutton, U. Thrane, F. Trail, A. Van-Diepeningen, H.D. Vanetten, A. Vijoen, C. Waalwijk, T.J. Ward, M.J. Wingfield, J.R. Xu, X.B. Yaang, T. Yli-Mattila, and N. Zhang. 2013. One fungus, one name: defining the genus Fusarium in a scientifically robust way that preserves longstanding use. Phytopathol. 103:400-408. doi:10.1094/PHYTO-07-12-0150-LE
Gómez-López, E.D. 2008. Caracterización de cepas toxigénicas del género Fusarium mediante técnicas de biología molecular. Tesis Doc., Universidad Politécnica de Valencia, ESP.
Gómez-López, E.D., N.C. Mesa, C.A. Hernández-M, Y.M. Mena, K. Imbachi, J.A. Salazar, S. Benítez, R. López, E.I. Estrada, R. Reina, E.D. Henao, O.E. Sánchez, Y. García, C.A. Huertas, I. Rodríguez, G.M. Cobo, M.L. Velasco, D. Vásquez, E.Y. Sánchez, P. Ramos, Y. Peteche, Y. Piza, S. Rodríguez, E.P. Barinas, L. Álvarez, C. Vega, H. Marulanda, L.A. Londoño, O. Sánchez, P.E Gamboa, y R. Romero. 2014. Programa de manejo fitosanitario en el maracuyá en el Departamento del Valle del Cauca. Universidad Nacional de Colombia, COL.
Henao, E.D., E.D. Gómez, C.A. Hernández, C. Salazar, y M.L. Velasco. 2015. Caracterización molecular de aislamientos de hongos del género Fusarium asociados a aguacate, en el Valle del Cauca-Colombia. En: Sociedad Chilena de Fitopatología, editores, Memorias XXIV Congreso de la Sociedad Chilena de Fitopatología. Viña del Mar, CHI. p. 32.
Hernández, C.A., E.D. Gómez, E.D. Henao, M.L. Velasco, and S. Rodríguez. 2015a. Molecular characterization of Fusarium isolates associated with fruit-bearing plants in Valle del Cauca, Colombia. ASCOLFI 39(1):11.
Hernández, C.A., E.D. Henao, M.L. Velasco, y E.D. Gómez. 2015b. Caracterización morfológica y molecular de aislados de Fusarium asociadas aguacate (Persea americana Mill), en el Valle del Cauca. Fitopatol. Colomb. 39:51-56.
Kikot, G. 2012. Caracterización bioquímica, fenotípica y molecular de aislamientos de Fusarium graminearum provenientes de la región pampeana en relación a la patogenicidad. Tesis Doc., Universidad Nacional de La Plata, Buenos Aires, ARG. http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/18266 (consultado jul. 2016).
Leslie, J.F., B.A. Summerell, and S. Bullock. 2006. The Fusarium laboratory manual. Blackwell Publishing, Ames, IA, USA.
Li, L.Y., Y. Ding, I. Groth, K.D. Menzel, G. Peschel, K. Voigt, Z.W. Deng, I. Sattler, and W.H. Lin. 2008. Pyrrole and indole alkaloids from an endophytic Fusarium incarnatum (HKI00504) isolated from the mangrove plant Aegiceras corniculatum. J. Asian Nat. Prod. Res. 10:765-770. doi:10.1080/10286020802031106
Lin, Z., S. Xu, Y. Que, J. Wang, J.C. Comstock, J. Wei, P.H. McCord, B. Chen, R. Chen, and M. Zhang. 2014. Species-specific detection and identification of Fusarium species complex, the causal agent of sugarcane pokkah boeng in China. PloSOne 9:e104195. doi:10.1371/journal.pone.0104195.
Martínez-Bolaños, A.M. 2012. Evaluación y selección de cepas de Trichoderma sp. para control biológico de Fusarium sp. en maracuyá (Passiflora edulis, variedad flavicarpa), en condiciones in vitro. Tesis Lic., Universidad Técnica de Ambato, Ambato, ECU.
Nelson, P.E., A.E. Desjardins, and R.D. Plattner. 1993. Fumonisins, mycotoxins produced by Fusarium species: biology, chemistry, and significance. Ann. Rev. Phytopathol. 31:233-252. doi:10.1146/annurev.py.31.090193.001313
Nelson, P.E., M.C. Dignani, and E.J. Anaissie. 1994. Taxonomy, biology, and clinical aspects of Fusarium species. Clin. Microbiol. Rev. 7:479-504. doi:10.1111/j.1470-9465.2004.00845.x?
Ocampo, J., R. Urrea, K. Wyckhuys, y M. Salazar. 2013. Exploración de la variabilidad genética del maracuyá (Passiflora edulis f. flavicarpa Degener) como base para un programa de fitomejoramiento en Colombia. Acta Agron. 62:352-360.
O’Donnell K., H.C. Kistler, E. Cigelnik, and R.C. Ploetz. 1998. Multiple evolutionary origins of the fungus causing Panama disease of banana: concordant evidence from nuclear and mitochondrial gene genealogies. Proc. Natl. Acad. Sci. 95: 2044-2049. doi:10.1073/pnas.95.5.2044
O’Donnell, K., D.A. Sutton, A. Fothergill, D. McCarthy, M.G. Rinaldi, M.E. Brandt, N. Zhang, and D.M. Geiser. 2008. Molecular phylogenetic diversity, multilocus haplotype nomenclature, and in vitro antifungal resistance within the Fusarium solani species complex. J. Clin. Microbiol. 46:2477-2490. doi:10.1128/JCM.02371-07
Ortu, G., M.L. Bertetti, M.L. Gullino, and A. Garibaldi. 2013. A new forma specialis of Fusarium oxysporum on Crassula ovata. J. Plant Pathol. 95:33-39. doi:10.4454/JPP.V95I1.003
Parry, D.W., P. Jenkinson, and L. McLeod. 1995. Fusarium ear blight (scab) in small grain cereals - a review. Plant Pathol. 44:207-238. doi:10.1111/j.1365-3059.1995.tb02773.x
Pérez, Y., G. Gómez, M. González, D. Vaillant, E. Ramos, J.R. Palacios, M. Pérez, y J. Almándoz. 2012. Hongos patógenos en plantas ornamentales de importancia para Cuba. Fitosanidad 15:205-214.
Perniola, O.S., S. Staltari, S.E. Chorzempa, M.M. Astiz-Gassó, and M.d.C. Molina. 2014. Control biológico de Fusarium graminearum: utilización de Trichoderma spp. y biofumigación con parte aérea de Brassica juncea. Rev. Fac. Cienc. Agrar. Univ. Nac. Cuyo 46(2):45-56.
Ramdial, H., F. Hosein, and S.N. Rampersad. 2016. First report of Fusarium incarnatum associated with fruit disease of bell peppers in Trinidad. Plant Dis. 100:526-526. doi:10.1094/PDIS-05-15-0550-PDN
Salazar-González, C., L. Serna-Cock, y E. Gómez-López. 2016. Caracterización molecular de Fusarium asociado a pudrición basal del fruto en Pitahaya (Selenicereus megalanthus). Agron. Mesoam. 27:277-285. doi:10.15517/am.v27i2.21269
Seta, S., M. Gonzalez, and G. Lori. 2004. First report of walnut canker caused by Fusarium incarnatum in Argentina. Plant Pathol. 53:248. doi:10.1046/j.1365-3059.2003.00968.x
Singh, B., C.S. Kalha, V.K. Razdan, and V.S. Verma. 2011. First report of walnut canker caused by Fusarium incarnatum from India. Plant Dis. 95:1587-1587. doi:10.1094/PDIS-04-11-0352
Valencia-Guerrero, M., B. QuevedoHidalgo, M. Franco-Correa, H. Diez-Ortega, C.M. Parra-Giraldo, y M.X. Rodríguez-Bocanegra. 2011. Evaluación de actividades enzimáticas de Fusarium spp., aislados de lesiones en humanos, animales y plantas. Universitas Sci. 16:147-159. doi:10.11144/javeriana.SC16-2.aoec
Wilson, K. 1987. Preparation of genomic DNA from bacteria. In: F.M. Ausubel et al., editors, Current protocols in molecular biology. John Wiley and Sons, USA. p. 2.4.1-2.4.5.
Wulff, E.G., J.L. Sørensen, M. Lübeck, K.F. Nielsen, U. Thrane, and J. Torp. 2010. Fusarium spp. Associated with rice Bakanae: ecology, genetic diversity, pathogenicity and toxigenicity. Environ. Microbiol. 12:649-657. doi:10.1111/j.1462-2920.2009.02105.x
Archivos adicionales
- Figura 1. Demarcación geográfica de las cinco localidades donde se colectaron aislamientos de Fusarium, en el Valle del Cauca-Colombia.2016.
- Figura 2. Árbol filogenético y agrupación por clados de las secuencias de Fusarium con el primer TEF 1 alpha , con raíz de C.rosea. Febrero 2016.
- Declaración Juramentada
Publicado
Cómo citar
Número
Sección
Licencia
1. Política propuesta para revistas de acceso abierto
Los autores/as que publiquen en esta revista aceptan las siguientes condiciones:
- Los autores/as conservan los derechos morales de autor y ceden a la revista el derecho de la primera publicación, con el trabajo registrado con la licencia de atribución, no comercial y sin obra derivada de Creative Commons, que permite a terceros utilizar lo publicado siempre que mencionen la autoría del trabajo y a la primera publicación en esta revista, no se puede hacer uso de la obra con propósitos comerciales y no se puede utilizar las publicaciones para remezclar, transformar o crear otra obra.
- Los autores/as pueden realizar otros acuerdos contractuales independientes y adicionales para la distribución no exclusiva de la versión del artículo publicado en esta revista (p. ej., incluirlo en un repositorio institucional o publicarlo en un libro) siempre que indiquen claramente que el trabajo se publicó por primera vez en esta revista.
- Se permite y recomienda a los autores/as a publicar su trabajo en Internet (por ejemplo en páginas institucionales o personales) antes y durante el proceso de revisión y publicación, ya que puede conducir a intercambios productivos y a una mayor y más rápida difusión del trabajo publicado (vea The Effect of Open Access).