Extraction and amplification of DNA from orchid exsiccates conserved for more than half a century in a herbarium in Bogotá, Colombia

  • Laura C. Mazo Instituto de Genética Humana, Facultad de Medicina, Pontificia Universidad Javeriana, Cra 7 # 40-62, edificio 32, Bogotá D.C., 110231, Colombia
  • Alberto Gómez Instituto de Genética Humana, Facultad de Medicina, Pontificia Universidad Javeriana, Cra 7 # 40-62, edificio 32, Bogotá D.C., 110231, Colombia. Iniciativa Genómica Javeriana, Pontificia Universidad Javeriana, Cra 7 # 40-62, edificio 32, Bogotá D. C., 110231, Colombia.
  • Sonia R. Quintanilla Instituto de Genética Humana, Facultad de Medicina, Pontificia Universidad Javeriana, Cra 7 # 40-62, edificio 32, Bogotá D.C., 110231, Colombia. Iniciativa Genómica Javeriana, Pontificia Universidad Javeriana, Cra 7 # 40-62, edificio 32, Bogotá D. C., 110231, Colombia.
  • Jaime E. Bernal Instituto de Genética Humana, Facultad de Medicina, Pontificia Universidad Javeriana, Cra 7 # 40-62, edificio 32, Bogotá D.C., 110231, Colombia. Iniciativa Genómica Javeriana, Pontificia Universidad Javeriana, Cra 7 # 40-62, edificio 32, Bogotá D. C., 110231, Colombia.
  • Pedro Ortiz Valdivieso Iniciativa Genómica Javeriana, Pontificia Universidad Javeriana, Cra 7 # 40-62, edificio 32, Bogotá D. C., 110231, Colombia. Asociación Bogotana de Orquideología, Avenida calle 63 # 68G-14, Bogotá D. C., Colombia.
Palabras clave: dna, adna, orchids, matk, exsiccates, herbarium

Resumen

Los tejidos vegetales provenientes de muestras de herbario contienen ADN que ha sufrido degradación post-mortem. Solo pequeñas cantidades de material genético eventualmente degradado, libre de químicos e impurezas, puede ser extraído de dichas muestras. El presente trabajo buscó comparar y determinar cuál de los tres protocolos de extracción seleccionados, que habían sido publicados previamente para ADN vegetal, permitía extraer ADN de buena calidad, susceptible de ser amplificado y secuenciado, a partir de exsicados de orquídeas conservadas en herbario hasta por 63 años. De los protocolos evaluados, el más eficaz permitió obtener y secuenciar productos amplificados en 6 de las 7 muestras estudiadas, con las mejores relaciones de pureza ADN / proteína.
Cómo citar
Mazo, L., Gómez, A., Quintanilla, S., Bernal, J., & Ortiz Valdivieso, P. (1). Extraction and amplification of DNA from orchid exsiccates conserved for more than half a century in a herbarium in Bogotá, Colombia. Lankesteriana: International Journal on Orchidology, 12(2). https://doi.org/10.15517/lank.v0i0.11762