El Anuario de Estudios Centroamericanos emplea distintos medios para preservar sus publicaciones, de esta manera asegura el contenido intelectual de los distintos documentos con los cuales se trabaja. Se cuenta con un registro digital de cada volumen publicado, desde el año 1974. 

Mensualmente, el Equipo editorial respalda los archivos que corresponden a las distintas etapas del proceso de publicación. Cada archivo cuenta con tres copias, resguardadas en distintos sitios. 

Copias de seguridad: La revista cuenta con discos duros portátiles que se mantienen en la oficina del Anuario.

Almacenamiento en plataformas digitales: Se mantienen carpetas en Google Drive y en Dropbox, de manera que todos los archivos puedan ser consultados inmediatamente, desde cualquier parte, por las personas integrantes del Equipo editorial.

Repositorios institucionales: Desde el año 2010, el Repositorio Kérwá almacena, difunde y preserva la producción científica y académica de la Universidad de Costa Rica. Asimismo, cada volumen del Anuario se aloja en el Repositorio Nacional Kímuk, entre otros.